vspВопросы современной педиатрииCurrent Pediatrics1682-55271682-5535Издательство «ПедиатрЪ»10.15690/vsp.v13i1.912vsp-227Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESИССЛЕДОВАНИЕ АССОЦИАЦИИ ПОЛИМОРФНЫХ МАРКЕРОВ ГЕНОВ СЕМЕЙСТВА IL1 (IL1B И ILRA) С КЛИНИЧЕСКИМИ ВАРИАНТАМИ ПИЕЛОНЕФРИТАSTUDY OF THE ASSOCIATION OF POLYMORPHOUS MARKERS FOR IL1 FAMILY GENES (IL1B AND ILRA) WITH CLINICAL VARIANTS OF PYELONEPHRITISКондратьеваЕ. И.Kondrat'evaE. I.elenafpk@mail.ruТерентьеваА. А.Terent'evaA. A.elenafpk@mail.ruТарасенкоН. В.TarasenkoN. V.elenafpk@mail.ruЛошковаЕ. В.LoshkovaE. V.elenafpk@mail.ruТлифА. И.TlifA. I.elenafpk@mail.ruКубанский государственный медицинский университет, Краснодар Медико-генетический научный центр, МоскваРоссияKuban State Medical University, Krasnodar Medical Genetics Research Centre of RAMS, MoscowRussian FederationСибирский государственный медицинский университет, ТомскРоссияSiberian State Medical University, TomskRussian FederationНИИ медицинской генетики СО, ТомскРоссияResearch Institute of Medical Genetics, Siberian Branch of RAMS, TomskRussian FederationКубанский государственный медицинский университет, КраснодарРоссияKuban State Medical University, KrasnodarRussian Federation201411012014131Вопросы современной педиатрии6064Copyright © Кондратьева Е.И., Терентьева А.А., Тарасенко Н.В., Лошкова Е.В., Тлиф А.И., 20142014Кондратьева Е.И., Терентьева А.А., Тарасенко Н.В., Лошкова Е.В., Тлиф А.И.Kondrat'eva E.I., Terent'eva A.A., Tarasenko N.V., Loshkova E.V., Tlif A.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://vsp.spr-journal.ru/jour/article/view/227

Цель исследования: изучить распределение аллелей и генотипов полиморфных маркеров генов семейства IL1 (IL1B и ILRA) в формировании хронического пиелонефрита и его клинических вариантов. Пациенты и методы: проанализирована выборка больных хроническим пиелонефритом из 99 человек. Средний возраст пациентов 8,01±3,26 (3,00–15,00) лет. Изучение полиморфных маркеров исследуемых генов проводили с помощью ПДРФ-анализа. Для проведения полимеразной цепной реакции использовали структуры праймеров и условия генотипирования, описанные в литературе. Результаты: анализ ассоциаций двух локусов генов семейства IL1 (IL1B и ILRA) с различными комплексными фенотипами хронического пиелонефрита продемонстрировал, что аллель А2 и генотип А2А2 полиморфизма IL1RN*VNTR ассоциированы с хроническим пиелонефритом, пузырно-мочеточниковым рефлюксом, вторичным пиелонефритом, нарушением функции почек, предрасположенностью к инфицированию кишечной палочкой и клебсиеллой. Генотип А2А2 гена IL1RN*VNTR и аллель А2 гена IL1RN*VNTR ассоциированы с нарушением функции почек OR =3,07 (р =0,001). Наиболее высокий риск развития хронической почечной недостаточностью установлен для генотипа А1А2 (OR =22,94; р =0,001). Выводы: обнаруженные ассоциации требуют дальнейшего подтверждения на выборках большего размера и разной этнической принадлежности.

Aim

Aim: to study the distribution of alleles and genotypes of polymorphic markers for immunoregulatory cytokines in the development of chronic pyelonephritis and its clinical variants. Patients and Methods: in this study we analyzed a sample of 99 patients with chronic pyelonephritis. The average age of the patients was 8,01±3,26 (3,00–15,00) years. The study of gene polymorphisms was performed using PDRF analysis. For PCR were used primers structures and genotyping conditions described in the literature. Results: the analysis of associations of 2 loci in the genes of cytokines with different complex phenotypes of chronic pyelonephritis demonstrated that A2 allele and genotype A2A2 of IL1RN*VNTR polymorphism is associated with chronic pyelonephritis, vesicoureteral reflux, secondary pyelonephritis, renal dysfunction, infection with Escherichia coli and Klebsiella. Genotype A2A2 of gene IL1RN*VNTR and allele A2 of gene IL1RN*VNTR are associated with impaired renal function OR =3,07 (p =0,001). The highest risk of chronic renal failure development is associated with A1A2 genotype (OR =22,94; p=0,001). Conclusions: the discovered associations require further confirmation on larger samples and various ethnicities.

 

 

воспалениехронический пиелонефритгены семейства IL1inflammationchronic pyelonephritisIL1 family genesReferencesKondrat'eva E.I., Puzyrev V.P, Nazarenko L.P., Rudko A.A., Yankina G.N., Loshkova E.V. Vopr. det. dietol. = Problems of pediatric nutritiology. 2008; 5: 11–16.Kondrat'eva E.I., Puzyrev V.P, Nazarenko L.P., Rudko A.A., Yankina G.N., Loshkova E.V. Vopr. det. dietol. = Problems of pediatric nutritiology. 2008; 5: 11–16.Kondratieva E.I., Rudko A.A., Loshkova E.V., Puzyrev V.P., Yankina G.N. Mol. Biol. 2008; 1: 42–49.Kondratieva E.I., Rudko A.A., Loshkova E.V., Puzyrev V.P., Yankina G.N. Mol. Biol. 2008; 1: 42–49.Kondratieva E.I., Tarasenko N., Puzyrev V. Eur. J. Hum. Gen. 2008; 2: 293.Kondratieva E.I., Tarasenko N., Puzyrev V. Eur. J. Hum. Gen. 2008; 2: 293.Tarasenko N.V. Yakutskii meditsinskii zhurnal = Yakut medical journal. 2009; 2: 135–139.Tarasenko N.V. Yakutskii meditsinskii zhurnal = Yakut medical journal. 2009; 2: 135–139.Cave M.C., Hurt R.T., Frazier T.H. Nutr. Clin. Pract. 2008; 23 (1): 16–34.Cave M.C., Hurt R.T., Frazier T.H. Nutr. Clin. Pract. 2008; 23 (1): 16–34.Tilg H., Moschen A.R. Mol. Med. 2008; 3–4: 222–231.Tilg H., Moschen A.R. Mol. Med. 2008; 3–4: 222–231.Kondrat'eva E.I., Yankina G.N., Loshkova E.V., Tarasenko N.V. Kubanskii nauchn. med. vestn. = Kuban scientific medical bulletin. 2011; 6: 12–17.Kondrat'eva E.I., Yankina G.N., Loshkova E.V., Tarasenko N.V. Kubanskii nauchn. med. vestn. = Kuban scientific medical bulletin. 2011; 6: 12–17.Chuprova A.V., Loskutova S.A., Trunov A.N., Pekareva N.A., Panteleeva E.Yu. Pediatriya = Pediatrics. 2008; 3: 23–27.Chuprova A.V., Loskutova S.A., Trunov A.N., Pekareva N.A., Panteleeva E.Yu. Pediatriya = Pediatrics. 2008; 3: 23–27.Goncharova I.A., Freidin M.B., Rudko A.A., Napalkova O.V., Kolokolova O.V., Ondar E.A., Dunaeva L.E., Beloborodova E.V., Puzyrev V.P. Vestnik VOGiS = Bulletin of VSGBS. 2006; 3: 540–552.Goncharova I.A., Freidin M.B., Rudko A.A., Napalkova O.V., Kolokolova O.V., Ondar E.A., Dunaeva L.E., Beloborodova E.V., Puzyrev V.P. Vestnik VOGiS = Bulletin of VSGBS. 2006; 3: 540–552.Naslednikova I.O., Urazova O.I., Voronkova O.V. Bull. Exp. Biol. Med. 2009; 2: 175–180.Naslednikova I.O., Urazova O.I., Voronkova O.V. Bull. Exp. Biol. Med. 2009; 2: 175–180.Shevchenko A.V., Golovanova O.V., Konenkov V.I., Strel'tsova E.I. Med. immunol. = Medical immunology. 2007; 2: 114–118.Shevchenko A.V., Golovanova O.V., Konenkov V.I., Strel'tsova E.I. Med. immunol. = Medical immunology. 2007; 2: 114–118.Kurganova E.V., Golovanova O.V., Shevchenko A.V., Rakova I.G., Strel'tsova E.I., Ostanin A.A., Chernykh E.R., Konenkov V.I. Tsitokiny i vospalenie = Cytokines and inflammation. 2007; 2: 40–45.Kurganova E.V., Golovanova O.V., Shevchenko A.V., Rakova I.G., Strel'tsova E.I., Ostanin A.A., Chernykh E.R., Konenkov V.I. Tsitokiny i vospalenie = Cytokines and inflammation. 2007; 2: 40–45.Ondar E. A. Tuberkulez v Respublike Tyva: epidemiologiya, kliniko-sotsial'nye osobennosti i geneticheskie osnovy podverzhennosti. Avtoref. dis. … dokt. med. nauk [Tuberculosis in the Republic of Tyva: Epidemiology, Clinical and Social Characteristics and the Genetic Basis of Susceptibility. Author’s abstarct]. Novosibirsk, 2007. 47 p.Ondar E. A. Tuberkulez v Respublike Tyva: epidemiologiya, kliniko-sotsial'nye osobennosti i geneticheskie osnovy podverzhennosti. Avtoref. dis. … dokt. med. nauk [Tuberculosis in the Republic of Tyva: Epidemiology, Clinical and Social Characteristics and the Genetic Basis of Susceptibility. Author’s abstarct]. Novosibirsk, 2007. 47 p.Petrosyan E.K., Tsygin A.N., Shestakov A.E. Nefrologiya = Nephrology. 2006; 3: 48–54.Petrosyan E.K., Tsygin A.N., Shestakov A.E. Nefrologiya = Nephrology. 2006; 3: 48–54.Bataeva E. P. Avtoref. … dis. kand. med. nauk [Author’s abstarct]. Moscow, 2012. 21 p.Bataeva E. P. Avtoref. … dis. kand. med. nauk [Author’s abstarct]. Moscow, 2012. 21 p.Konenkov V.I., Smol'nikova M.V. Byull. eksp. biol. i meditsiny = Bulletin of experimental biology and medicine. 2002; 4: 449–451.Konenkov V.I., Smol'nikova M.V. Byull. eksp. biol. i meditsiny = Bulletin of experimental biology and medicine. 2002; 4: 449–451.Maniatis T., Frich E., Sembuk Dzh. Metody geneticheskoi inzhenerii. Molekulyarnoe klonirovanie [Methods of Genetic Engineering. Molecular Cloning]. Moscow, Mir, 1984. 480 p.Maniatis T., Frich E., Sembuk Dzh. Metody geneticheskoi inzhenerii. Molekulyarnoe klonirovanie [Methods of Genetic Engineering. Molecular Cloning]. Moscow, Mir, 1984. 480 p.Patel R., Lim D.S., Reddy D. et al. Variants of trophic factors and expression of cardiac hypertrophy in patients with hypertrophic cardiomyopathy. J. Mol. Cell. Cardiol. 2000; 32 (12): 2369–2377.Patel R., Lim D.S., Reddy D. et al. Variants of trophic factors and expression of cardiac hypertrophy in patients with hypertrophic cardiomyopathy. J. Mol. Cell. Cardiol. 2000; 32 (12): 2369–2377.Tarlow J.K., Blakemore I.F., Lennard A. et al. Polymorphism in human IL-1 receptor antagonist gene intron 2 is caused by variable number of an 86-bp tandem repeat. Hum. Genet. 1993; 91: 403–404.Tarlow J.K., Blakemore I.F., Lennard A. et al. Polymorphism in human IL-1 receptor antagonist gene intron 2 is caused by variable number of an 86-bp tandem repeat. Hum. Genet. 1993; 91: 403–404.Wilkinson R.J., Patel P., Llewelyn M. et al. Influence of polymorphism in the genes for the interleukin (IL)-1 receptor antagonist and IL1-β on tuberculosis. J. Exp. Med. 1999; 189 (12): 1863–1873.Wilkinson R.J., Patel P., Llewelyn M. et al. Influence of polymorphism in the genes for the interleukin (IL)-1 receptor antagonist and IL1-β on tuberculosis. J. Exp. Med. 1999; 189 (12): 1863–1873.Bland J.M., Altman D.G. Statistics notes. The odds ratio. BMJ. 2000; 320 (7247): 1468.Bland J.M., Altman D.G. Statistics notes. The odds ratio. BMJ. 2000; 320 (7247): 1468.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.